• 干细胞与再生医学研究
• 未来先进核裂变能
• 空间科学
• 应对气候变化的碳收支认证及相关问题
• 面向感知中国的新一代信息技术研究
• 低阶煤清洁高效梯级利用
• 分子模块设计育种创新体系
• 变革性纳米技术聚焦
• 江门中微子实验
• 热带西太平洋海洋系统物质能量交换及其影响
• 个性化药物-基于疾病分子分型普惠新药研发
• 智能导钻技术装备体系与相关理论研究
• 空间科学（二期）
• 器官重建与制造
• 临近空间科学实验系统
• 变革性洁净能源关键技术与示范
• 深海/深渊智能技术及海底原位科学实验站
• 泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设
• 地球大数据科学工程
• 美丽中国生态文明建设科技工程

• 国家数学交叉科学中心
• 量子系统的相干控制
• 脑功能联结图谱与类脑智能研究
• 青藏高原多圈层相互作用及其资源环境效应
• 超导电子器件应用基础研究
• 大气灰霾追因与控制
• 海斗深渊前沿科技问题研究与攻关
• 拓扑与超导新物态调控
• 生物超大分子复合体的结构、功能与调控
• 宇宙结构起源—从银河系的精细刻画到深场宇宙的统计描述
• 页岩气勘探开发基础理论与关键技术
• 作物病虫害的导向性防控—生物间信息流与行为操纵
• 功能pi-体系的分子工程
• 动物复杂性状的进化解析与调控
• 典型污染物的环境暴露与健康危害机制
• 土壤-微生物系统功能及其调控
• 超强激光与聚变物理前沿研究
• 能源化学转化的本质与调控
• 地球内部运行机制与表层响应
• 细胞命运可塑性的分子基础与调控
• 结构与功能导向的新物质创制
• 基于原子的精密测量物理
• 超常环境下系统力学问题研究与验证
• 多波段引力波宇宙研究
• 大规模光子集成芯片
• 下一代高场超导磁体关键科学与技术
• 关键地史时期生物与环境演变过程及其机制
• 植物特化性状形成的分子基础及定向发育调控
• 拓扑物态与量子计算研究
• 病原体宿主适应与免疫干预
• 功能导向的原子制造前沿科学问题
• 大尺度区域生物多样性格局与生命策略
• 脑认知与类脑前沿研究